本师释迦牟尼佛大慈大悲，晚年讲《药师琉璃光如来本愿功德经》，反复阐明像法、末法时期的诸多问题。更让人痛心的是个别修弥陀法门的人就有抵触药师法门的现象，既不知药师本愿，也不知广博多闻，更不知往生西方极乐世界所需的福德资粮与智慧资粮。当代高僧弘一法师、印光法师慈悲为怀，为药师经版留下的文字，足以看出两位大德对药师经的推崇。
一、弘一法师当年答佛学书局的一封信：承前惠书，谓今药师如来圣诞，才疑别刊行专号撰文以为提倡，近多忙碌未暇撰文，谨拙见如下，以备参考焉，余自信佛法以来，专宗弥陀净土法门，专宗弥陀净土法门，但亦当讲《药师如来本愿功德经》，讲此经时所最注意者三事：一若犯戒者，闻药师名号已还得清净。二若求生西方极乐世界，而未定者，得闻药师名号。三现生种种厄难悉得消除。故亦劝诸缁素应读诵药师功德经，并执持药师名号，而于求生东方净土琉璃世界之文，未极详释，谓为别被一机也。今者佛学书局诸贤，欲弘扬药师圣典，提倡求生东方胜愿，大心甚可钦佩，但依拙见，唯可普劝众生诵经，持名，至于求生何处，宜任其自然亦可发心诵药师经并持名号，而与本愿无违。因经中谓求生极乐者，命终有八大菩萨示路，又东晋译本云，若欲得生兜率天上见弥勒者，亦当礼敬药师琉璃光佛，如是弘一则范围甚广。可以群机并育矣，略陈拙见，敬乞有以教之，幸甚。
二、印光法师（净土法门的第十三祖师）《药师如来本愿经重刻跋》
佛与众生心体是一，而心之相用则天渊悬殊，由相用悬殊故，其所受用者，亦复天渊悬殊也。
佛则唯以无缘大慈，同体大悲，渡脱众生为怀，了无人我彼此之心，纵度尽一切众生，亦不见能度所度之相，故得福慧具足。为世间尊，众生则唯以自私自利为事，虽父母兄弟之亲，尚不能无彼此之相，况旁人世人乎哉！故其所感业报，或生贫穷下贱或堕三途恶道，即令戒善禅定自修得生人天乐处，但以无大悲心，不能直契菩提。以致福报一尽，仍复堕落，可不哀哉。
是则唯欲利人者，正成就其自利，而唯欲自利者，乃适所以自害也，药师如来本愿经者，乃我释迦世尊，愍念此界一切罪苦众生，为说药师如来因中果上，利生之事实，为究竟离苦得乐之无上妙法也。
众生果能发慈悲喜舍之大菩提心，受持此经此咒及此佛名号，推其功效，尚可以豁破无明，圆成佛道，况其余种种果位，种种福乐乎哉，然在佛心固欲以无上觉道，全体授与一切众生，而众生智有浅深，固不得不随其所乐，令彼所求各各如愿也。
须知药师一经及与佛号，并其神咒，即释迦药师所得之阿耨多罗三藐三菩提法，凡至诚受持者，即是以佛庄严而自庄严也。
药师经跋
------玉琳国师
予辞恩绝尘，不暇披览，偶入藏阅药师如来本愿功德，不觉手额失声，愿人人入如来愿海也。或问何于此经惊叹如是？告之曰：予见世人顺境沦溺者不一。富贵可畏，甚于贫贱，今此如来，使人所求如愿，遂从此永不退道，直至菩提，则欲于王臣长者，一切人中作同事摄。不乘如来愿航，何从济乎？大凡修持，须量己量法，直心直行。诚能厌恶三界，坚志往生，则专依阿弥陀经，收摄六根，净念相继，所谓执持名号，一心不乱，决定往生。此先自利，而后利人者之所为也。若于现前富贵功名未能忘情，男女饮食之欲，未知深厌，则于往生法门，未易深信。即信矣，身修净土而心恋娑婆，果何益乎。则求其不离欲钩，而成佛智，处于顺境，不致沦胥者，固无如修持药师愿海者之殊胜难思也。若能信行，久久不懈，知不独富贵功名，转女成男，离危迪吉，如如意珠，遂愿成就。即得于一切成就处，直至菩提。永无退转，何幸如之。人间亦有扬州鹤，但泛如来功德船。
两大法门
竺摩法师
药师与弥陀两大法门，在释迦佛法中应该平衡发展才对，可是大家多知道有弥陀法门，求生净土，很少人知道有药师法门，能够延寿长生，这是什么原因呢？大概是中国佛法在晚唐的时候，经过三武一宗的毁法，天台贤首性相各宗经论皆被摧毁，唯禅宗不立文字，不用经典，山林水边，皆可做其功夫，故唯禅宗流盛，其他显教各种法门，皆告衰微。到了宋朝，宗匠不多，禅宗亦渐走下坡，而念佛法门，有起而代之之势。一句弥陀，天下披靡，所以净土法门独盛，人皆偏于念佛往生，送死度亡；致使消灾增福，现生可以随愿所求的药师法门，反而隐晦不扬，好似全部佛法，就只有净土法门全权代表，其他法门都一落千丈了！
到了清朝，有位玉琳国师出现，他阅大藏经，发见《药师经》，觉到药师佛所发的十二大愿，多是注重福利现世众生，繁荣现实社会。他觉得这个法门很合时代潮流，对偏重弥陀法门来讲，是有补偏救弊的作用，他就出来提倡，且替《药师经》流通本做了一篇很好的序文，里面有两句动人的诗句说：‘人间亦有扬州鹤，但泛如来功德船’。他对于这部经可谓推重备至。
在他两句诗中，还有一点意义要说明：从前有四个友人闲谈自己的爱好；一个爱有钱十万，享受富贵生活；一个爱去扬州玩耍，觉得扬州是人间天堂；一个爱骑鹤上天云游四海；另一个则很坦白，亦很漂亮，他要爱钱、爱去扬州、亦爱骑鹤去扬州。正所谓‘腰缠十万贯，骑鹤上扬州’，样样都要得到如愿以偿。现在玉琳国师的诗意，就在你们只要誧《药师经》，照《药师经》修行，游泛药师如来的功德法船，人间什么富贵都可以求得，“腰缠十万贯，骑鹤上扬州”，更无问题了。
又玉琳国师对于弘扬这《药师经》的因缘，还有好多好多。相传玉琳前世为僧，相貌奇丑。有相府千金之女布施财物，来寺分派众僧，分至此丑僧之前，心惊憎厌，不分给他。僧有感触，专礼药师佛，愿求来世相貌美丽，不使人家讨厌。结果转世为玉琳，相貌美丽、英俊非凡；而那位相府千金，因斋僧布施，转世仍为千金小姐，追求玉琳，费尽心机，不得所愿，生起相思病来，奄奄一息，几乎呜呼，未曾哀哉。后因相府邀请，玉琳收她为徒，教她打佛七，不敷脂粉，一心用功，睡不足，食不够，不断地坐香和跑香，七天之后，她的样子不是夜叉，亦成丑鬼。玉琳叫她对镜看看，你的美丽在那里？小姐见到镜中丑样，顿悟人生如幻，一切无常。后来亦发心学佛，不贪人间富贵，骑鹤上天，而是归心净土，神游净域了。
在《药师经》中还有一个特别的说法，在其他经中并不多见。他说我们人生下来就有两个“俱生神”，与生俱来，跟着我们，记载我们一生所作的善恶，一神记善，一神记恶，“随其所作，若罪若福，皆具书之”，历历分明，一丝不紊，到各人临终之时，此二神负责将此纪录罪福之书，“尽持授与阎魔法王”，由王凭此纪录，推算罪福，而判定之。有福者上升，自无问题，造罪者将沦苦处，忧怖万状，那时若有在生亲戚家眷为他诵经礼忏，忏悔修福，亦可减轻他们业报，所以这《药师径》虽然注重延生求福延寿，同时亦注意到亡者的利益，可谓“冥阳两利，存殁均沾”之宝典。吾人学佛目的为“净佛国土，成就众生”，那就不可不注意修习了！
香赞
炉香乍爇，法界蒙熏，诸佛海会悉遥闻，
随处结祥云，诚意方殷，诸佛现全身。
南无香云盖菩萨摩诃萨（三称）
净口业真言
唵，修利，修利，摩诃修利，修修利，萨婆诃。
安土地真言
南无三满多，母驮喃，唵，度噜度噜，地尾，娑婆诃。
普供养真言
唵，誐誐曩，三婆嚩，袜日啰斛。
发愿文
稽首三界尊，皈命十方佛，我今发宏愿，持此药师经，上报四重恩，下济三涂苦，若有见闻者，悉发菩提心，尽此
一身报，同生琉璃国；原如母有情众生，身体健康无病苦，心里健康无烦恼，灵性健康断轮回。
开经偈
无上甚深微妙法，百千万劫难遭遇，
我今见闻得受持，愿解如来真实义。
药师三尊
南无药师琉璃光如来（三称）
南无日光遍照菩萨（三称）
南无月光遍照菩萨（三称）
奉请八大菩萨
南无文殊师利菩萨。南无观世音菩萨。
南无得大势菩萨。南无无尽意菩萨。
南无宝檀华菩萨。南无药王菩萨。
南无药上菩萨。南无弥勒菩萨。
奉请十二药叉大将
奉请：宫毗罗大将。奉请：伐折罗大将。
奉请：迷企罗大将。奉请：安底罗大将。
奉请：额你罗大将。奉请：珊底罗大将。
奉请：因达罗大将。奉请：波夷罗大将。
奉请：摩虎罗大将，奉请：真达罗大将。
奉请：招杜罗大将。奉请：毗羯罗大将。
南无药师会上佛菩萨（三称）
药师琉璃光如来本愿功德经唐三藏法师玄奘奉诏译
第一、法会缘起分
如是我闻：一时薄伽(qié)梵(fàn)，游化诸国，至广严城住乐音树下。与大苾(bì)刍(chú)众八千人俱，菩萨摩诃萨三万六千及国王大臣、婆罗门、居士、天龙八部、人非人等无量大众恭敬围绕，而为说法。
第二、文殊师利启请分
尔时曼殊室利法王子，承佛威神，从座而起，偏袒一肩，右膝着地，向薄伽梵，曲躬合掌白言：世尊，惟愿演说如是相类诸佛名号，及本大愿殊胜功德。令诸闻者，业障消除，为欲利乐像法转时诸有情故。
尔时世尊，赞曼殊室利童子言，善哉！善哉！曼殊室利，汝以大悲，劝请我说诸佛名号、本愿功德，为拔业障所缠有情，利益安乐像法转时诸有情故。汝今谛听，极善思惟，当为汝说。曼殊室利言：唯然愿说，我等乐闻。
第三、药师琉璃光如来分
佛告曼殊室利：东方去此过十殑(jìng)伽沙等佛土，有世界名净琉璃，佛号药师琉璃光如来，应正等觉、明行圆满、善逝、世间解、无上士、调御(yù)丈夫、天人师、佛、薄伽梵。
第四、药师如来十二大愿分
曼殊室利：彼佛世尊药师琉璃光如来，本行菩萨道时，发十二大愿，令诸有情，所求皆得。
第一大愿：愿我来世，得阿耨多罗三藐三菩提时，自身光明炽(chì)然，照耀(yào)无量无数无边世界。以三十二大丈夫相，八十随形，庄严其身。令一切有情，如我无异。
第二大愿：愿我来世得菩提时，身如琉璃，内外明彻，净无瑕(xiá)秽(huì)，光明广大，功德巍(wēi)巍，身善安住，焰网庄严，过于日月；幽冥众生，悉蒙开晓。随意所趣，作诸事业。
第三大愿：愿我来世得菩提时，以无量无边智慧方便，令诸有情，皆得无尽所受用物，莫令众生有所乏少。
第四大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，行邪道者，悉令安住菩提道中。若行声闻独觉乘者，皆以大乘而安立之。
第五大愿：愿我来世得菩提时，若有无量无边有情，于我法中，修行梵行，一切皆令得不缺戒，具三聚戒。设有毁犯，闻我名已，还得清净，不堕恶趣。
第六大愿：愿我来世得菩提时。若诸有情，其身下劣，诸根不具，丑陋顽愚，盲聋喑(yīn)哑，挛(luán)躄(bì)背偻(lóu)，白癞(lài)癫狂，种种病苦。闻我名已，一切皆得端正黠(xiá)慧，诸根完具，无诸疾苦。
第七大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，众病逼切，无救无归，无医无药，无亲无家，贫穷多苦。我之名号，一经其耳，众病悉除，身心安乐，家属资具，悉皆丰足，乃至证得无上菩提。
第八大愿：愿我来世得菩提时，若有女人，为女百恶之所逼恼，极生厌离，愿舍女身。闻我名已，一切皆得转女成男，具丈夫相，乃至证得无上菩提。
第九大愿：愿我来世得菩提时，令诸有情，出魔罥(juàn)网，解脱一切外道缠缚(fù)。若堕种种恶见稠(chóu)林，皆当引摄置于正见，渐令修习诸菩萨行，速证无上正等菩提。
第十大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，王法所录，繩(shéng)缚鞭挞(tà)，系闭牢狱，或当刑戮(lù)，及余无量灾难凌辱，悲愁煎迫，身心受苦。若闻我名，以我福德威神力故，皆得解脱一切忧苦。
第十一大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，饥渴所恼，为求食故，造诸恶业。得闻我名，专念受持，我当先以上妙饮食，饱足其身，后以法味，毕竟安乐而建立之。
第十二大愿：愿我来世得菩提时，若诸有情，贫无衣服，蚊虻(méng)寒热，昼夜逼恼，若闻我名，专念受持，如其所好，即得种种上妙衣服，亦得一切宝庄严具，华鬘(mán)涂香，鼓乐众伎(jì)，随心所玩，皆令满足。
曼殊室利，是为彼世尊药师琉璃光如来，应、正等觉，行菩萨道时，所发十二微妙上愿。
第五、净琉璃世界分
复次曼殊室利，彼世尊药师琉璃光如来，行菩萨道时，所发大愿，及彼佛土功德庄严，我若一劫，若一劫余，说不能尽。然彼佛土，一向清净，无有女人，亦无恶趣，及苦音声；琉璃为地，金绳界道，城阙(quē)宫阁，轩窗罗网，皆七宝成；亦如西方极乐世界，功德庄严，等无差别。于其国中，有二菩萨摩诃萨。一名日光遍照。二名月光遍照。是彼无量无数菩萨众之上首，次补佛处，悉能持彼世尊药师琉璃光如来正法宝藏。是故曼殊室利！诸有信心善男子，善女人等，应当愿生彼佛世界。
第六、闻佛名恶趣得度分
尔时，世尊复告曼殊师利童子言：曼殊室利！有诸众生，不识善恶，唯怀贪吝(lìn)，不知布施及施果报。愚痴无智，缺于信根，多聚财宝，勤加守护。见乞者来，其心不喜，设不获已而行施时，如割身肉，深生痛惜。复有无量悭(qiān)贪有情，积集资财，于其自身尚不受用，何况能与父母妻子，奴婢、作使，及来乞者。彼诸有情，从此命终，生饿鬼界或傍生趣。由昔人间曾得暂闻药师琉璃光如来名故，今在恶趣，暂得忆念彼如来名，即于念时，从彼处没，还生人中，得宿命念，畏恶趣苦，不乐欲乐，好行惠施，赞叹施者。一切所有，悉无贪惜。渐次尚能以头目、手足、血肉、身分，施来求者，况余财物。
复次曼殊室利！若诸有情，虽于如来受诸学处，而破尸罗。有虽不破尸罗，而破轨则，有于尸罗轨则，虽得不坏，然毁正见。有虽不毁正见，而弃多闻，于佛所说契(qì)经深义，不能解了。有虽多闻而增上慢，由增上慢覆蔽心故，自是非他，嫌(xián)谤正法，为魔伴党。如是愚人，自行邪见，复令无量俱胝(zhī)有情，堕大险坑。此诸有情，应于地狱、傍生、鬼趣，流转无穷。若得闻此药师琉璃光如来名号，便舍恶行，修诸善法，不堕恶趣。设有不能舍诸恶行、修行善法，堕恶趣者。以彼如来本愿威力，令其现前暂闻名号，从彼命终，还生人趣，得正见精进，善调意乐。便能舍家，趣于非家，如来法中，受持学处，无有毁犯，正见多闻，解甚深义，离增上慢，不谤正法，不为魔伴，渐次修行诸菩萨行，速得圆满。
复次，曼殊室利！若诸有情，悭(qiān)贪嫉妒，自赞毁他，当堕三恶趣中，无量千岁受诸剧苦。受剧苦已。从彼命终。来生人间。作牛马驼驴。恒被鞭挞，饥渴逼恼，又常负重，随路而行。或得为人，生居下贱，作人奴婢，受他驱役，恒不自在。若昔人中，曾闻世尊药师琉璃光如来名号，由此善因，今复忆念，至心归依，以佛神力，众苦解脱，诸根聪利，智慧多闻，恒求胜法，常遇善友，永断魔罥(juàn)，破无明壳(què)，竭(jié)烦恼河，解脱一切生老病死，忧愁苦恼。
复次，曼殊室利，若诸有情，好喜乖(guāi)离，更相斗讼，恼乱自他，以身语意，造作增长种种恶业，展转常为不饶益事，互相谋害，告召山林树冢(zhǒng)等神，杀诸众生，取其血肉，祭祀药叉、罗刹(chà)婆等；书怨人名，作其形像，以恶咒术而咒诅(zǔ)之；魇(yǎn)魅蛊(gǔ)道，咒起尸鬼，令断彼命，及坏其身，是诸有情，若得闻此药师琉璃光如来名号，彼诸恶事，悉不能害，一切展转皆起慈心，利益安乐，无损恼意，及嫌恨心，各各欢悦，于自所受，生于喜足，不相侵凌，互为饶益。
第七、四众善果分
复次，曼殊室利！若有四众，苾(bì)刍(chú)、苾刍尼、邬(Wū)波索迦、邬波斯迦(jiā)，及余净信善男子、善女人等，有能受持八分斋戒，或经一年，或复三月，受持学处，以此善根，愿生西方极乐世界无量寿佛所，听闻正法，而未定者。若闻世尊药师琉璃光如来名号，临命终时，有八大菩萨，其名曰：文殊师利菩萨。观世音菩萨。得大势菩萨。无尽意菩萨。宝坛华菩萨。药王菩萨。药上菩萨。弥勒菩萨。是八大菩萨。乘空而来，示其道路，即于彼界种种杂色众宝华中，自然化生。或有因此生于天上。虽生天上，而本善根，亦未穷尽，不复更生诸余恶趣。天上寿尽，还生人间，或为轮王统摄四洲，威德自在，安立无量百千有情，于十善道。或生刹帝利、婆罗门、居士大家，多饶财宝，仓库盈(yíng)溢(yì)，形相端正，眷属具足，聪明智慧，勇健威猛，如大力士。若是女人，得闻世尊药师如来名号，至心受持，于后不复更受女身。
第八、光中说咒分
复次，曼殊室利！彼药师琉璃光如来得菩提时，由本愿力，观诸有情，遇众病苦，瘦挛、干消、黄热等病；或被魇(yǎn)魅、蛊(gǔ)毒所中，或复短命，或时横(hèng)死，欲令是等病苦消除，所求愿满。时彼世尊入三摩地，名曰：除灭一切众生苦恼。既入定已，于肉髻(jì)中出大光明，光中演说大陀罗尼曰：
na mo bo qie fa di bi sha she ju lu
南 无 薄 伽 伐 帝，鞞 杀 社，窶 噜，
bi liu li bo la po he ra she ye da tuo
薜 琉 璃，钵 喇 婆，喝 啰 阇 也，怛 他
jie duo ye a ra he di san miao san bu tuo ye
揭 多 耶， 阿 啰诃 帝， 三 藐 三 勃 陀 耶
ta zhi tuo ong pi sha shi pi sha shi
怛 姪 他，唵， 鞞 杀 逝， 鞞 杀 逝，
pi sha she san mo jie di suo he
鞞 杀 社， 三 没 揭 帝， 莎诃。
而时光中说此咒已，大地震动，放大光明，一切众生，病苦皆除，受安隐乐。
第九、持咒灭病分
曼殊室利！若见男子、女人，有病苦者，应当一心为彼病人，常清净澡漱(shù)，或食或药，或无虫水，咒一百八遍，与彼服食，所有病苦，悉皆消灭。若有所求，至心念诵，皆得如是，无病延年。命终之后，生彼世界，得不退转，乃至菩提。是故文殊师利，若有男子、女人，于彼药师琉璃光如来，至心殷(yīn)重，恭敬供养者，常持此咒，勿令废忘。
第十、供佛遂愿四天守护分
复次，曼殊室利！若有净信男子、女人，得闻药师琉璃光如来，应正等觉，所有名号，闻已诵持。晨嚼(jiáo)齿木，澡漱清净，以诸香花，烧香涂香，作众伎乐，供养形象。于此经典，若自书，若教人书，一心受持，听闻其义。于彼法师应修供养，一切所有资身之具，悉皆施与，勿令乏少。如是便蒙诸佛护念，所求愿满，乃至菩提。
尔时，曼殊室利童子白佛言：“世尊，我当誓于像法转时，以种种方便，令诸净信善男子、善女人等，得闻世尊药师琉璃光如来名号，乃至睡中，亦以佛名觉悟其耳。
世尊，若于此经受持读诵，或复为他演说开示，若自书，若教人书，恭敬尊重，以种种华香、涂香、末香、烧香、华鬘(mán)璎(yīng)珞(luò)、幡(fān)盖伎乐，而为供养。以五色彩，作囊(náng)盛之，洒扫净处，敷(fū)设高座，而用安处。而时，四大天王与其眷属，及余无量百千天众，皆诣(yì)其所，供养守护。世尊，若此经宝流行之处，有能受持，以彼世尊药师琉璃光如来本愿功德，及闻名号，当知是处，无复横死，亦复不为诸恶鬼神夺其精气。设已夺者，还得如故，身心安乐。
佛告曼殊室利：“如是如是，如汝所说，曼殊室利，若有净信善男子、善女人等，欲供养彼世尊药师琉璃光如来者，应先造立彼佛形象，敷清净座，而安处之。散种种花，烧种种香，以种种幢(chuáng) 幡，庄严其处。七日七夜，受八分斋戒，食清净食，澡浴香洁，著清净衣，应生无垢浊心，无怒害心。于一切有情，起利益、安乐、慈悲、喜舍、平等之心，鼓乐歌赞，右绕佛像。复应念彼如来本愿功德，读诵此经，思维其义，演说开示，随所乐求，一切皆遂。求长寿得长寿，求富饶得富饶，求官位得官位，求男女得男女。
第十一、供佛解脱众怖分
若复有人，忽得恶梦，见诸恶相，或怪鸟来集，或于住处百怪出现。此人若以众妙资具，恭敬供养彼世尊药师琉璃光如来者，恶梦恶相，诸不吉祥，皆悉隐没，不能为患。或有水火，刀毒悬险恶象，狮子、虎狼、熊罴(pí)、毒蛇、恶蝎、蜈蚣、蚰(yóu)蜒(yán)、蚊虻(méng)等怖，若能至心忆念彼佛，恭敬供养，一切怖畏皆得解脱。若他国侵扰，盗贼反乱，忆念恭敬彼如来者，亦得解脱。
复次，曼殊室利，若有净信善男子、善女人等，乃至尽形不事余天，唯当一心归佛法僧，受持禁戒，若五戒、十戒、菩萨四百戒、比丘二百五十戒、比丘尼五百戒，于所受中，或有毁犯，怖堕恶趣，若能专念彼佛名号，恭敬供养者，必定不受三恶趣生。或有女人，临当产时，受于极苦，若能至心称名礼赞，恭敬供养彼如来者，众苦皆除，所生之子身分具足，形色端正，见者欢喜，利根聪明，安稳少病，无有非人夺其精气。”
第十二、诸佛甚深行处分
尔时，世尊告阿难言：“如我称扬彼世尊药师琉璃光如来所有功德，此是诸佛甚深行处，难可解了，汝为信不？”阿难白言：“大德世尊，我于如来所说契(qì)经，不生疑惑。所以者何？一切如来，身语意业，无不清净。世尊，此日月轮可令堕落，妙高山王可使倾动，诸佛所言，无有异也。
世尊，有诸众生，信根不具，闻说诸佛甚深行处，作是思惟：云何但念药师琉璃光如来一佛名号，便获尔所功德胜利，由此不信，返生诽谤，彼于长夜，失大利乐，堕诸恶趣，流转无穷。”
佛告阿难：“是诸有情，若闻世尊药师琉璃光如来名号，至心受持，不生疑惑，堕恶趣者无有是处。阿难，此是诸佛甚深所行，难可信解，汝今能受，当知皆是如来威力。阿难，一切声闻、独觉、及未登地诸菩萨等，皆悉不能如实信解，唯除一生所系菩萨。阿难，人身难得，于三宝中，信敬尊重，亦难可得。闻世尊药师琉璃光如来名号，复难于是。阿难，彼药师琉璃光如来，无量菩萨行，无量善巧方便，无量广大愿，我若一劫，若一劫余，而广说者，劫可速尽，彼佛行愿善巧方便，无有尽也。”
第十三、供佛续命分
尔时，众中有一菩萨摩诃萨，名曰：救脱，即从座起，偏袒右肩，右膝著地，曲躬合掌，而白佛言：“大德世尊，像法转时，有诸众生，为种种患之所困厄(è)，长病羸(léi)瘦，不能饮食，喉唇干燥，见诸方暗，死相现前，父母亲属，朋友知识，涕泣(qì)围绕。然彼自身，卧于本处，见阎魔使，引其神识，至于阎魔法王之前。然诸有情，有俱生神，随其所作，若罪若福，皆具书之，尽持授与阎魔法王。尔时，彼王推问其人，计算所作，随其罪福而处断之。时彼病人，亲属知识，若能为彼，皈依世尊药师琉璃光如来，请诸众僧，转读此经，燃七层之灯，悬五色续命神幡。或有是处，彼识得还，如在梦中，明了自见。或经七日，或二十一日，或三十五日，或四十九日，彼识还时，如从梦觉，皆自忆知善不善业，所得果报。由自证见业果报故，及至命难，亦不造作诸恶之业。是故净信善男子、善女人等，皆应受持药师琉璃光如来名号，随力所能，恭敬供养。” 尔时，阿难问救脱菩萨曰：“善男子应云何恭敬供养，彼世尊药师琉璃光如来？续命幡灯，复云何造？”
救脱菩萨言：“大德，若有病人，欲脱病苦，当为其人，七日七夜受持八分斋戒。应以饮食，及余资具，随力所办，供养比丘僧，昼夜六时，礼拜行道。供养彼世尊药师琉璃光如来，读诵此经四十九遍，燃四十九灯，造彼如来形象七躯，一一像前，各置七灯，一一灯量，大如车轮，乃至四十九日，光明不绝。造五色彩幡长四十九搩（zhé）手。应放杂类众生至四十九。可得过度危厄之难，不为诸横恶鬼所持。
第十四、供佛解脱众难分
复次，阿难，若刹帝利、灌(guàn)顶王等，灾难起时，所谓人众疾疫难，他国侵逼难，自界叛逆难，星宿变怪难，日月薄蚀(shí)难，非时风雨难，过时不雨难。 彼刹帝利、灌顶王等，尔时应于一切有情，起慈悲心，赦(shè)诸系闭。依前所说供养之法，供养彼世尊药师琉璃光如来。由此善根及彼如来本愿力故，令其国界，即得安隐，风雨顺时，谷稼成熟，一切有情，无病欢乐。于其国中，无有暴恶药叉等神，恼有情者，一切恶相，皆即隐没。而刹帝利、灌顶王等，寿命色力，无病自在，皆得增益。
阿难，若帝后妃主，储君王子，大臣辅相，中宫婇女，百官黎庶(shù)，为病所苦，及余厄难，亦应造立五色神旛，燃灯续明，放诸生命，散杂色花，烧众名香，病得除愈，众难解脱。”尔时，阿难问救脱菩萨言：“善男子，云何已尽之命，而可增益？”救脱菩萨言：“大德，汝岂不闻如来说有九横死耶？是故劝造续命幡灯，修诸福德，以修福故，尽其寿命，不经苦患。”
阿难问言：“九横云何？”救脱菩萨言：“若诸有情，得病虽轻，然无医药，及看病者，设复遇医，授以非药，实不应死，而便横死。又信世间邪魔外道妖孽(niè)之师，妄说祸福，便生恐动，心不自正，卜问觅(mì)祸，杀种种众生，解奏神明，呼诸魍(wǎng)魉(liǎng)，请乞福佑，欲冀延年，终不能得。愚痴迷惑，信邪倒见，遂令横死，入于地狱，无有出期，是名初横。 二者、横被王法之所诛戮(lù)。三者、畋(tián)猎嬉戏，耽(dān)淫嗜(shì)酒，放逸无度，横为非人夺其精气。四者、横为火焚。五者、横为水溺(nì)。六者、横为种种恶兽所啖 (dàn)。七者、横堕山崖。八者、横为毒药，厌祷(dǎo)咒诅(jǔ)，起尸鬼等之所中害。九者、饥渴所困，不得饮食，而便横死。是为如来略说横死有此九种。其余复有无量诸横，难可具说。复次，阿难，彼阎魔王主领世间名籍之记，若诸有情，不孝五逆，破辱三宝，坏君臣法，毁于性戒。阎魔法王随罪轻重，考而罚之。是故我今劝诸有情，燃灯造旛，放生修福，令度苦厄，不遭众难。”
第十五、药叉大将护法分
尔时，众中有十二药叉大将，俱在会座。所谓：宫毗(pí)罗大将，伐折罗大将，迷企罗大将，安底罗大将，额你罗大将，珊底罗大将，因达罗大将，波夷罗大将，摩虎罗大将，真达罗大将，招杜罗大将，毗羯(jié)罗大将。此十二药叉大将，一一各有七千药叉以为眷属，同时举声白佛言：“世尊，我等今者蒙佛威力，得闻世尊药师琉璃光如来名号，不复更有恶趣之怖。我等相率，皆同一心，乃至尽形，归佛法僧，誓当荷负一切有情，为作义利，饶益安乐。随于何等村城国邑，空闲林中，若有流布此经，或复受持药师琉璃光如来名号，恭敬供养者，我等眷属，卫护是人，皆使解脱一切苦难。诸有愿求，悉令满足。或有疾厄求度脱者，亦应读诵此经，以五色缕，结我名字，得如愿已，然后解结。”尔时，世尊赞诸药叉大将言：“善哉，善哉，大药叉将，汝等念报世尊药师琉璃光如来恩德者，常应如是利益安乐一切有情。”
第十六、奉持法门分
尔时，阿难白佛言：“世尊，当何名此法门，我等云何奉持？”佛告阿难：“此法门名说：药师琉璃光如来本愿功德；亦名说：十二神将，饶益有情，结愿神咒；亦名：拔除一切业障，应如是持。”时薄伽梵说是语已，诸菩萨摩诃萨，及大声闻、国王大臣、婆罗门、居士、天、龙、药叉、健达缚、阿素洛、紧那罗、摩呼罗伽、人、非人等，一切大众，闻佛所说，皆大欢喜，信受奉行。
